1452年にニコラウス５世は、コンスタンティヌス帝が320年頃に建てた，初の聖堂を建て直すと決めた。しかし実際の工事は，1506年にユリウス２世の下でブラマンテの設計で始められた。ブラマンテの後に，ラッファエッロ，バルダッサッレ・ペルッツィBaldassarre Peruzzi，およびアントニオ・ダ・サンガッロ・イル・ジョーヴァネAntonio da Sangallo il Giovaneが設計を継承し，長い間ギリシャ十字式設計（十字の縦横の長さが等しい）となるのかラテン十字式設計（十字の縦の方が長い）とするのか定まらなかった。1546年以降はミケランジェロに設計が委託され，ギリシャ十字設計で高部にはクーポラを造り，広場の中央に置かれた大聖堂が設計された。彼のあと，設計はヴィニョーラVignola、ピッロ・リゴリオPirro Ligorio，ジャコモ・デッラ・ポルタ Giacomo della Porta，および，ドメニコ・フオンターナDomenico Fontanaに受け継がれた。1607年、パウルス５世の命で，力ルロ・マデルノはラテン十字に戻すことにし，教会の前方の袖を延ばし，内部に脇の３礼拝堂を加えた。さらにマデルノは，フアサードも制作した。
1626年11月18日，ウルバヌス８世がこの大聖堂を献堂した。　NTTガイド p195

ヴァチカンにおいてベルニーニは次のように加わっていく。
1624年、ウルバヌス８世に命じられてバルダッキーノの制作を始めたのが最初で、1629年にカルロ・マデルノが死去したため、サン・ピエトロの主任建築士となり、ファサードの改築と大聖堂内部全体の構成、装飾をも任される。
大聖堂内部バルダッキーノ制作
　　〃 聖ロンギヌスらの柱の装飾
私の子羊を飼いなさい
ウルバヌス８世の記念碑
マティルダの墓
ファサードの改築（鐘楼案）

1644年にウルバヌス８世が死去しイノケンティウス10世が教皇になると、ベルニーニはヴァチカンから遠ざけられ、ボッロミーニがその地位につく。

1656年にアレクサンデル７世が教皇になると再びヴァチカンはベルニーニのもとになり、改めて広場の建設と教皇宮殿の整備改築を担うことになる。
コロンナートの制作
教皇宮殿の改築
大聖堂内部玉座の祭壇制作

1673年にクレメンス10世が教皇になっても引き続きベルニーニはヴァチカンの主であり、新たにサクラメント礼拝堂のチボーリオの制作を含む装飾を任される。